牛羊肉真空冻干机基本原理是基于水的三态变化。水有固态、液态和气态，三种状态既可以相互转换又可以共存。当水在三相点（温度为0.01℃，水蒸气压为610.5Pa）时，水、冰、水蒸气三者可共存且相互平衡。宠物食品冻干加工经过预冻、一次干燥、解析干燥三个阶段完成，根据物料的共晶点和共熔点要求，确定预冻温度在宠物食品物料共晶点得更低-15~-20℃进行低温冷冻成固态，然后在物料的共熔点以下进行一次干燥除去90%左右的流离水，再进行解析干燥阶段，升华干燥剩余的结合水，整个干燥过程需要在真空下完成。在-30℃时，冻干过程就是将固体的冰升华为气体。当真空度达到300Pa的时候，在0℃左右开始蒸发，使物料迅速干燥。冻干食品的水分小于3%，可以存放十年之久。

真空系统进行抽真空把一部分水份带走；另一方面是物料受冻时把某些分子中所含水份排到物料的表面冻结，达到冷冻要求后，由加热系统对物料加热干燥，通过抽真空把物料中所含的水份带到冷冻捕集箱结冻，达到物料冷冻干燥要求。